Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPRL3Q12980 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms