Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms