Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NMBRP28336 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NMBRP28336 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
NMBRP28336 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NMBRP28336 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NMBRP28336 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NMBRP28336 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NMBRP28336 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NMBRP28336 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NMBRP28336 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NMBRP28336 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NMBRP28336 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NMBRP28336 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NMBRP28336 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NMBRP28336 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NMBRP28336 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NMBRP28336 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NMBRP28336 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NMBRP28336 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NMBRP28336 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NMBRP28336 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms