Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPREP23469 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPREP23469 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPREP23469 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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