Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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