Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRHP20396 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRHP20396 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRHP20396 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRHP20396 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRHP20396 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRHP20396 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRHP20396 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRHP20396 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRHP20396 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRHP20396 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRHP20396 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRHP20396 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRHP20396 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRHP20396 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRHP20396 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRHP20396 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRHP20396 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRHP20396 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRHP20396 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms