Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms