Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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