Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms