Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms