Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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CCDC142Q17RM4 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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CCDC142Q17RM4 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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CCDC142Q17RM4 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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CCDC142Q17RM4 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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CCDC142Q17RM4 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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CCDC142Q17RM4 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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CCDC142Q17RM4 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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