Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA3Q16787 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
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