Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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