Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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DDB1Q16531 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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DDB1Q16531 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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DDB1Q16531 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
DDB1Q16531 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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