Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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CCDC6Q16204 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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CCDC6Q16204 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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CCDC6Q16204 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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CCDC6Q16204 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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CCDC6Q16204 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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CCDC6Q16204 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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CCDC6Q16204 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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CCDC6Q16204 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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CCDC6Q16204 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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CCDC6Q16204 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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CCDC6Q16204 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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