Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZIC1Q15915 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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