Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TTF1Q15361 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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