Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRRQ15256 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms