Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL19A1Q14993 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms