Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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