Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
SPTAN1Q13813 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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