Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDH18Q13634 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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