Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HDAC1Q13547 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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