Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDE3BQ13370 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms