Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms