Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms