Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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CNTN1Q12860 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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CNTN1Q12860 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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CNTN1Q12860 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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CNTN1Q12860 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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CNTN1Q12860 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CNTN1Q12860 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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CNTN1Q12860 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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CNTN1Q12860 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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CNTN1Q12860 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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