Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPEQ02224 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.8 ms