Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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