Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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