Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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SNX29Q8TEQ0 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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