Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCBE1Q6UXH8 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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