Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED9Q6R2W3 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms