Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153 ms