Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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SGCBQ16585 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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SGCBQ16585 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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SGCBQ16585 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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SGCBQ16585 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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