Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
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