Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHHQ15465 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SHHQ15465 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SHHQ15465 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SHHQ15465 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SHHQ15465 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SHHQ15465 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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