Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAPTM4AQ15012 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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