Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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