Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
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