Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms