Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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