Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALCAMQ13740 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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