Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTCH1Q13635 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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