Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL4BQ13620 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL4BQ13620 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms