Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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