Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TCOF1Q13428 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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