Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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