Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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NR1H3Q13133 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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NR1H3Q13133 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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NR1H3Q13133 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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NR1H3Q13133 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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NR1H3Q13133 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NR1H3Q13133 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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