Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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